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先輩研究者のご紹介 高屋 浩介さん [2025年12月16日(Tue)]
 こんにちは。科学振興チームです。
 本日は、2023年度「深層学習で挑む新たな個体及び交雑種判別手法:情報科学と野外調査でオオサンショウウオの保全に貢献する」という研究課題で笹川科学研究助成を受けられた、京都大学大学院農学研究科(助成時)の高屋 浩介さんからのお話をお届けします。

<高屋さんより>
 人工知能(AI)の飛躍的な進歩により私たちの社会が大きく変わり始めています。私はこのAIの技術を生物多様性の保全に応用する研究を進めています。笹川科学研究助成をいただき、2本の研究成果を発表することができたので、ご紹介させていただきます。

【研究@AIをオオサンショウウオの個体識別に応用した研究】
 野生動物を守るためには、対象となる種が野外でどのような生活をしているのか調べる必要があります。また、年齢や性別によって行動が変わる場合もあるため、様々な方法で個体を識別して観察する必要があります。例えば、鳥類では古くから足環が用いられており、両生類では小型のタグを体内に埋め込む手法などが用いられてきました。従来の方法でも対象種への負担を減らす配慮はなされてきましたが、私はAIの画像認識技術を動物の個体識別に応用できないだろうかと考えました。
 オオサンショウウオは日本固有の特別天然記念物であり、絶滅が心配されています。オオサンショウウオの模様は個体ごとに異なるため、この違いを利用したAIによる個体識別に挑戦しました(図1)。具体的にはオオサンショウウオの写真を撮影し、個体ごとの模様の違いをAIに学習してもらいました(図2)。解析の結果、一定の撮影条件下においては、高い精度で個体識別をできることが分かりました。この方法は写真を撮影するだけなので、対象種に与える負担を最小限にできます。また、オオサンショウウオのような長寿命の生き物は(まだ研究中ですが60年以上生存した記録も報告されています)、1人の研究者が生涯を通じて追跡調査することが困難です。そこで、寿命に制約のないAIを活用することで、世代を超えた長期的なモニタリングが可能となります。また、市民科学でも本技術の応用が期待されます(図3)。この成果はScientific Reportsに掲載されました(Takaya et al. 2023)

図1_2.jpg
図1.AIの画像認識技術を用いた個体識別  図2.研究に用いたオオサンショウウオたち


図3.jpg
図3.市民科学でAIを活用

【研究Aオオサンショウウオの交雑個体の識別にAIを応用した研究】
 外来種は生物多様性の減少の要因の1つとされています。外来種と在来種が近縁である場合、両者の間で交雑個体が生じることがあります。多くの動物では交雑個体は繁殖能力を持たないのですが、日本のオオサンショウウオと中国のチュウゴクオオサンショウウオの交雑個体には繁殖能力があることが知られています。そのため、在来のオオサンショウウオの遺伝的多様性の保全の観点から、交雑個体への対策が求められています。交雑個体を特定するためには遺伝的な解析が必要ですが、私はAIを用いて模様で交雑個体を識別できないだろうかと考えました(図4)。解析の結果、オオサンショウウオとチュウゴクオオサンショウウオを親世代に持つ個体(F1世代)では、画像から交雑個体を特定できる可能性が示唆されました。もちろん、正確な交雑個体の特定のためには遺伝的な解析が必須です。しかし、写真からある程度の精度で交雑個体の識別ができれば、野外で交雑の疑いがある個体を迅速に特定することができます。この成果はEcology and Evolutionに掲載され(Takaya et al. 2023)、2023年度の掲載論文の中で閲覧数トップ10%にランクインしました(図5)。

図4_5.jpg
図4.AIの画像認識技術を     図5.閲覧数上位10%に選ばれた
用いた交雑個体の判別       交雑個体に関する論文


【申請を検討されている方へのアドバイス】
 私は博士後期課程の研究で助成をいただきました。学振に採用されなかった私にとって、本当にありがたい助成でした。笹川科学研究助成がなければ、上記の研究は遂行できなかったかもしれません。特に、野外におけるサンプリングにはどうしても不確定な要素が影響します。例えば、雨で増水すれば河川での調査はできません。相手は野生動物なので、都合良く現れてくれるとも限りません(図6)。その点、笹川科学研究助成は研究上必要であれば使用用途を柔軟に変更できるため、他の助成制度と比較して、研究者にとって非常に助かるものでした。また、学振の不採択通知を受け取ると「自分の研究に意味なんてないのかな・・・」と落ち込んでしまいましたが、笹川科学研究助成に採択されたことで前を向くエネルギーもいただきました。ぜひ、応募を検討されている方は積極的に挑戦してみてください。
 現在、私は島根大学に講師として着任し、オオサンショウウオだけでなく、ツキノワグマやタヌキなどの哺乳類も対象種として研究を続けています。研究ができるありがたい環境に感謝しつつ、学生や次世代の研究者の育成にも力を入れることで、これまで私が受けてきた様々なサポートへの恩返しができればと考えています。最後になりましたが、金銭的にも精神的にも温かいご支援をいただいた日本科学協会の皆様に、心より感謝申し上げます。改めて、本研究に助成をいただき、ありがとうございました。

図6.jpg
図6.真夜中の河川で必死にオオサンショウウオを探す助成者


【参考文献】
Takaya, K., Taguchi, Y., & Ise, T. (2023) Individual identification of endangered amphibians using deep learning and smartphone images: case study of the Japanese giant salamander (Andrias japonicus). Scientific Reports, 13, 16212. doi.org/10.1038/s41598-023-40814-1

Takaya, K., Taguchi, Y., & Ise, T. (2023) Identification of hybrids between the Japanese giant salamander (Andrias japonicus) and Chinese giant salamander (Andrias cf. davidianus) using deep learning and smartphone images. Ecology and Evolution, 13, e10698. doi.org/10.1002/ece3.10698


<以上>


 日本科学協会では過去助成者の皆様より、研究成果や近況についてのご報告をお待ちしております。最後までお読みいただき、ありがとうございました。


※テキスト、画像等の無断転載・無断使用、複製、改変等は禁止いたします。
Posted by 公益財団法人 日本科学協会 at 10:02 | 笹川科学研究助成 | この記事のURL | コメント(0) | トラックバック(0)
先輩研究者のご紹介 伊藤 愛さん [2025年12月02日(Tue)]
 こんにちは。科学振興チームです。
 本日は、2023年度「哺乳類と両生類から探る脊椎動物の陸生適応による心室心筋細胞の力学特性の変化」という研究課題で笹川科学研究助成を受けられた、名古屋工業大学の伊藤 愛さんからのお話をお届けします。

<伊藤さんより>
 私は、脊椎動物の心臓の機能や力学特性が生息環境によってどのように異なるのかに興味があり、研究を進めています。生物の活動を支える心臓は軟組織であるため、一般的には化石として残りません。そのため、地球環境の変化とともに脊椎動物の心臓がどのように進化してきたのかを明らかにするために、現生動物の心臓から進化の道筋を探るという方針で研究を行っています。
 2023年度笹川科学研究助成では、上陸によって生息環境が水生から陸生へ移行した際に、心臓の機能や力学特性がどのように変化したのかを検討する研究に対して、ご支援をいただきました。これまでの研究により、水生に比べて陸生の両生類・爬虫類の心室の壁の方が厚く、コラーゲンを豊富に含んでおり、心室が硬いということが明らかになりました(図1)。


図1.png
図1 研究概要

 学生という立場で申請できる研究費助成は多くありませんが、笹川科学研究助成は助成額が大きく、使用用途の制限も比較的緩やかであるため、博士後期課程で研究の幅を広げる上で、大変有難い制度でした。実際に、本助成に係る研究の論文発表のみならず、その後の研究費獲得に繋がる基盤となる研究も支えていただいたと感じています。
 2025年4月より、名古屋工業大学に助教として着任し、現在も同様のテーマで研究を継続しています。先日、ニュージーランド・オークランド(図2)で開催されたThe 13th Asian-Pacific Conference on Biomechanicsという学会では、本助成により得られた知見を発展させた最新の検討結果を発表しました。世界中の研究者との活発な議論を通じて、多くの新たな視点を得ることができました。

図2.png
図2 オークランドの夜景(学会懇親会会場の近くで撮影)


 周囲の博士後期課程に進学予定の修士学生や博士後期課程の学生にも、本助成制度を積極的に勧めています。申請書を書くことは、自身の研究を客観的に見つめ直す良い機会になりますし、さまざまな能力が鍛えられます。私自身、応募当時は研究助成の申請書を書き慣れていなかったので、大変勉強になりました。これを読んでいる方も、ぜひ挑戦してみてください。
 最後になりますが、研究の道を歩み始めたばかりの私に温かいご支援と挑戦の機会を与えてくださった日本科学協会の皆様に、心より感謝申し上げます。

<以上>


 日本科学協会では過去助成者の皆様より、研究成果や近況についてのご報告をお待ちしております。最後までお読みいただき、ありがとうございました。


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Posted by 公益財団法人 日本科学協会 at 10:49 | 笹川科学研究助成 | この記事のURL | コメント(0) | トラックバック(0)